David Torrents Arenales

2012

• Identification of novel type 2 diabetes candidate genes involved in the crosstalk between the mitochondrial and the insulin signaling systems.

  PLoS genetics

  J. M. Mercader, M. Puiggros, A. V. Segrè, E. Planet, E. Sorianello, D. Sebastian, S. Rodriguez-Cuenca, V. Ribas, S. Bonàs-Guarch, S. Draghici, C. Yang, S. Mora, A. Vidal-Puig, J. Dupuis, J. C. Florez, A. Zorzano, and D. Torrents
• Impact of methylation on the physical properties of DNA.

  Biophysical journal

  A. Pérez, C L. Castellazzi, F. Battistini, K. Collinet, O. Flores, O. Deniz, M L. Ruiz, D. Torrents, R. Eritja, M. Soler-López, and M. Orozco
• Prediction of regulatory regions using ReLA". 16th Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology

  16th Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology, RECOMB

  S. González, B. Montserrat, F. Sánchez, M. Puiggros, E. Blanco, L. Martinez, A. Ramirez, and D. Torrents
• BLUEPRINT to decode the epigenetic signature written in blood.

  Nature biotechnology

  D. Adams, L. Altucci, S. E. Antonarakis, J. Ballesteros, S. Beck, A. Bird, C. Bock, B. Boehm, E. Campo, A. Caricasole, F. Dahl, E. T. Dermitzakis, T. Enver, M. Esteller, X. Estivill, A. Ferguson-Smith, J. Fitzgibbon, P. Flicek, C. Giehl, T. Graf, F. Grosveld, R. Guigó, I. Gut, K. Helin, J. Jarvius, R. Küppers, H. Lehrach, T. Lengauer, A. Lernmark, D. Leslie, M. Loeffler, E. Macintyre, A. Mai, J H. Martens, S. Minucci, W. H. Ouwehand, P G. Pelicci, H. Pendeville, B. Porse, V. Rakyan, W. Reik, M. Schrappe, D. Schübeler, M. Seifert, R. Siebert, D. Simmons, N. Soranzo, S. Spicuglia, M. Stratton, H. G. Stunnenberg, A. Tanay, D. Torrents, A. Valencia, E. Vellenga, M. Vingron, J. Walter, and S. Willcocks
• ReLA, a local alignment search tool for the identification of distal and proximal gene regulatory regions and their conserved transcription factor binding sites

  Bioinformatics

  S. González, B. Montserrat, F. Sánchez, M. Puiggros, E. Blanco, A. Ramirez, and D. Torrents

2011

• Enterotypes of the human gut microbiome.

  Nature

  M. Arumugam, J. Raes, E. Pelletier, D. Le Paslier, T. Yamada, D. R. Mende, G. R. Fernandes, J. Tap, T. Bruls, J-M. Batto, M. Bertalan, N. Borruel, F. Casellas, L. Fernández, L. Gautier, T. Hansen, M. Hattori, T. Hayashi, M. Kleerebezem, K. Kurokawa, M. Leclerc, F. Levenez, C. Manichanh, B. H. Nielsen, T. Nielsen, N. Pons, J. Poulain, J. Qin, T. Sicheritz-Ponten, S. Tims, D. Torrents, E. Ugarte, E. G. Zoetendal, J. Wang, F. Guarner, O. Pedersen, W. M. de Vos, S. Brunak, J. Doré, M. Antolín, F. Artiguenave, H. M. Blottiere, M. Almeida, C. Brechot, C. Cara, C. Chervaux, A. Cultrone, C. Delorme, G. Denariaz, R. Dervyn, K. U. Foerstner, C. Friss, M. van de Guchte, E. Guedon, F. Haimet, W. Huber, J. van Hylckama-Vlieg, A. Jamet, C. Juste, G. Kaci, J. Knol, O. Lakhdari, S. Layec, K. Le Roux, E. Maguin, A. Mérieux, R. Melo Minardi, C. M'rini, J. Muller, R. Oozeer, J. Parkhill, P. Renault, M. Rescigno, N. Sanchez, S. Sunagawa, A. Torrejon, K. Turner, G. Vandemeulebrouck, E. Varela, Y. Winogradsky, G. Zeller, J. Weissenbach, D. S. Ehrlich, and P. Bork
• Whole-genome sequencing identifies recurrent mutations in chronic lymphocytic leukaemia.

  Nature

  X. S. Puente, M. Pinyol, V. Quesada, L. Conde, G. R. Ordóñez, N. Villamor, G. Escaramis, P. Jares, S. Beà, M. González-Díaz, L. Bassaganyas, T. Baumann, M. Juan, M. López-Guerra, D. Colomer, J. M. C. Tubío, C. López, A. Navarro, C. Tornador, M. Aymerich, M. Rozman, J. M. Hernández, D. A. Puente, J. M. P. Freije, G. Velasco, A. Gutiérrez-Fernández, D. Costa, A. Carrió, S. Guijarro, A. Enjuanes, L. Hernández, J. Yagüe, P. Nicolás, C. M. Romeo-Casabona, H. Himmelbauer, E. Castillo, J. C. Dohm, S. de Sanjosé, M. A. Piris, E. de Alava, J. San Miguel, R. Royo, J L. Gelpí, D. Torrents, M. Orozco, D. G. Pisano, A. Valencia, R. Guigó, M. Bayés, S. Heath, M. Gut, P. Klatt, J. Marshall, K. Raine, L. A. Stebbings, A. P. Futreal, M. R. Stratton, P. J. Campbell, I. Gut, A. López-Guillermo, X. Estivill, E. Montserrat, C. López-Otín, and E. Campo

2008

• DNAlive: a tool for the physical analysis of DNA at the genomic scale.

  Bioinformatics (Oxford, England)

  JR. Goñi, C. Fenollosa, A. Pérez, D. Torrents, and M. Orozco
• Is there selection for the pace of successive inactivation of the arpAT gene in primates?

  Journal of molecular evolution

  F. Casals, A. Ferrer-Admetlla, J. Chillarón, D. Torrents, M. Palacín, and J. Bertranpetit
• Projection structure of a member of the amino acid/polyamine/organocation transporter superfamily.

  The Journal of biological chemistry

  F. Casagrande, M. Ratera, A. D. Schenk, M. Chami, E. Valencia, J M. Lopez, D. Torrents, A. Engel, M. Palacín, and D. Fotiadis