Publications

Export results as:

Showing 1 - 10 results of 28

2024

ONCOLINER: A new solution for monitoring, improving, and harmonizing somatic variant calling across genomic oncology centers

Cell Genomics

R. Martín, N. Gaitán, F. Jarlier, L. Feuerbach, H. de Soyres, M. Arbonés, T. Gutman, M. Puiggròs, A. Ferriz, A. Gonzalez, L. Estelles, I. Gut, S. Capella-Gutierrez, L. D. Stein, B. Brors, R. Royo, P. Hupé, and D. Torrents

2023

Publisher Correction: Butler enables rapid cloud-based analysis of thousands of human genomes

Nature Biotechnology

S. Yakneen, S. M. Waszak, S. Yakneen, B. Aminou, J. Bartolome, K. A. Boroevich, R. Boyce, A. N. Brooks, A. Buchanan, I. Buchhalter, et al.
Wnt genes in colonic polyposis predisposition

Genes & Diseases

I. Quintana, M. Terradas, P. Mur, I. B. A. W. te Paske, S. Peters, I. Spier, V. Steinke-Lange, C. Maestro, D. Torrents, M. Puiggròs, R. Royo, R. Tonda, G. Parra, D. Piscia, S. Beltran, M. Navarro, V. Piñol, J. Brunet, N. Gonzalez-Abuin, G. Aiza, A. Sommer, Y. van Herwaarden, G. Astuti, E. Holinski-Feder, N. Hoogerbrugge, R. M. De Voer, S. Aretz, G. Capellá, and L. Valle

2022

Signatures of TOP1 transcription-associated mutagenesis in cancer and germlineAbstract

Nature

M. A. M. Reijns, D. A. Parry, T. C. Williams, F. Nadeu, R. L. Hindshaw, D. O. Rios Szwed, M. D. Nicholson, P. Carroll, S. Boyle, R. Royo, A. J. Cornish, H. Xiang, K. Ridout, J. C. Ambrose, P. Arumugam, R. Bevers, M. Bleda, F. Boardman-Pretty, C. R. Boustred, H. Brittain, M. J. Caulfield, G. C. Chan, G. Elgar, T. Fowler, A. Giess, A. Hamblin, S. Henderson, T. J. P. Hubbard, R. Jackson, L. J. Jones, D. Kasperaviciute, M. Kayikci, A. Kousathanas, L. Lahnstein, S. E. A. Leigh, I. U. S. Leong, J. F. Lopez, F. Maleady-Crowe, M. McEntagart, F. Minneci, L. Moutsianas, M. Mueller, N. Murugaesu, A. C. Need, P. O’Donovan, C. A. Odhams, C. Patch, M. Buongermin Pereira, D. Perez-Gil, J. Pullinger, T. Rahim, A. Rendon, T. Rogers, K. Savage, K. Sawant, R. H. Scott, A. Siddiq, A. Sieghart, S. C. Smith, A. Sosinsky, A. Stuckey, M. Tanguy, A. Lisa Taylo Tavares, E. R. A. Thomas, S. R. Thompson, A. Tucci, M. J. Welland, E. Williams, K. Witkowska, S. M. Wood, D. Chubb, A. Cornish, B. Kinnersley, R. Houlston, D. Wedge, A. Gruber, A. Frangou, W. Cross, T. Graham, A. Sottoriva, G. Caravagna, N. López-Bigas, C. Arnedo-Pac, D. Church, R. Culliford, S. Thorn, P. Quirke, H. Wood, I. Tomlinson, B. Noyvert, A. Schuh, K. Aden, C. Palles, E. Campo, T. Stankovic, M. S. Taylor, and A. P. Jackson
Detection of early seeding of Richter transformation in chronic lymphocytic leukemia

Nature Medicine

F. Nadeu, R. Royo, R. Massoni-Badosa, H. Playa-Albinyana, B. Garcia-Torre, M. Duran-Ferrer, K. J. Dawson, M. Kulis, A. Diaz-Navarro, N. Villamor, J. L. Melero, V. Chapaprieta, A. Dueso-Barroso, J. Delgado, R. Moia, S. Ruiz-Gil, D. Marchese, A. Giró, N. Verdaguer-Dot, M. Romo, G. Clot, M. Rozman, G. Frigola, A. Rivas-Delgado, T. Baumann, M. Alcoceba, M. González, F. Climent, P. Abrisqueta, J. Castellví, F. Bosch, M. Aymerich, A. Enjuanes, S. Ruiz-Gaspà, A. López-Guillermo, P. Jares, S. Beà, S. Capella-Gutierrez, J. Ll. Gelpi, N. López-Bigas, D. Torrents, P. J. Campbell, I. Gut, D. Rossi, G. Gaidano, X. S. Puente, P. M. Garcia-Roves, D. Colomer, H. Heyn, F. Maura, J. I. Martin-Subero, and E. Campo
ATM germline variants in a young adult with chronic lymphocytic leukemia: 8 years of genomic evolution

Blood Cancer Journal

R. Royo, L. Magnano, J. Delgado, S. Ruiz-Gil, J. Ll. Gelpi, H. Heyn, M. A. Taylor, T. Stankovic, X. S. Puente, F. Nadeu, and E. Campo

2021

2020

The proliferative history shapes the DNA methylome of B-cell tumors and predicts clinical outcome

Nature Cancer

M. Duran-Ferrer, G. Clot, F. Nadeu, R. Beekman, T. Baumann, J. Nordlund, Y. Marincevic-Zuniga, G. Lönnerholm, A. Rivas-Delgado, S. Martín, R. Ordoñez, G. Castellano, M. Kulis, A. C. Queirós, S-T. Lee, J. Wiemels, R. Royo, M. Puiggròs, J. Lu, E. Giné, S. Beà, P. Jares, X. Agirre, F. Prosper, C. López-Otín, X. S. Puente, C. C. Oakes, T. Zenz, J. Delgado, A. López-Guillermo, E. Campo, and J. Ignacio Martín-Subero
Butler enables rapid cloud-based analysis of thousands of human genomesAbstract

Nature Biotechnology

S. Yakneen, S. M. Waszak, M. Gertz, and J. O. Korbel
Sex differences in oncogenic mutational processes

Nature Communications

C. H. Li, S. D. Prokopec, R. X. Sun, F. Yousif, N. Schmitz, P. C. Boutros, and

Pages