Josep Gelpi

2017

• Four simple recommendations to encourage best practices in research software

  F1000Research

  R. C. Jiménez, M. Kuzak, M. Alhamdoosh, M. Barker, B. Batut, M. Borg, S. Capella-Gutierrez, N. Chue Hong, M. Cook, M. Corpas, M. Flannery, L. Garcia, J L. Gelpí, S. Gladman, C. Goble, M. González Ferreiro, A. Gonzalez-Beltran, P. C. Griffin, B. Grüning, J. Hagberg, P. Holub, R. Hooft, J. Ison, D. S. Katz, B. Leskošek, F. López Gómez, L. J. Oliveira, D. Mellor, R. Mosbergen, N. Mulder, Y. Perez-Riverol, R. Pergl, H. Pichler, B. Pope, F. Sanz, M. V. Schneider, V. Stodden, R. Suchecki, R. Svobodová Vařeková, H-A. Talvik, I. Todorov, A. Treloar, S. Tyagi, M. van Gompel, D. Vaughan, A. Via, X. Wang, N. S. Watson-Haigh, and S. Crouch
• Structural and energetic study of cation–π–cation interactions in proteins

  Physical Chemistry Chemical Physics

  S. Pinheiro, I. Soteras, J L. Gelpí, F. Dehez, C. Chipot, J. F. Luque, and C. Curutchet
• Genome-wide pathway analysis identifies VEGF pathway association with oral ulceration in systemic lupus erythematosus

  Arthritis Research & Therapy

  A. Aterido, A. Julià, P. Carreira, R. Blanco, J. Javier López-Longo, J. Javier Pé Venegas, À. Olivé, J. Luís Andreu, M. Ángeles Aguirre-Zamorano, P. Vela, J. M. Nolla, J. Luís Mare de la Fuente, A. Zea, J. María Pego, M. Freire, E. Díez, M. López-Lasanta, M. López-Corbeto, N. Palau, R. Tortosa, J L. Gelpí, D. Absher, R. M. Myers, A. Fernández-Nebro, and S. Marsal
• PMut: a web-based tool for the annotation of pathological variants on proteins, 2017 update

  Nucleic Acids Research

  V. López-Ferrando, A. Gazzo, X. de la Cruz, M. Orozco, and J L. Gelpí
• The Multiple Roles of Waters in Protein Solvation

  The Journal of Physical Chemistry B

  A. Hospital, M. Candotti, J L. Gelpí, and M. Orozco

2016

• Long-timescale dynamics of the Drew–Dickerson dodecamer

  Nucleic Acids Research

  P. D. Dans, L. Danilāne, I. Ivani, T. Dršata, F. Lankaš, A. Hospital, J. Walther, R. Illa Pujagut, F. Battistini, J L. Gelpí, R. Lavery, and M. Orozco
• BIGNASim: A NoSQL database structure and analysis portal for nucleic acids simulation data

  Nucleic Acids Research

  A. Hospital, P. Andrio, C. Cugnasco, L. Codó, Y. Becerra, P. Dans, F. Battistini, J. Torres, R. Goñi, M. Orozco, and J L. Gelpí
• A genome-wide association study identifies SLC8A3 as a susceptibility locus for ACPA-positive rheumatoid arthritis.

  Rheumatology

  A. Julià, I. González, A. Fernández-Nebro, F. Blanco, L. Rodriguez, A. González, J. D. Cañete, J. Maymó, M. Alperi-López, A. Olivé, H. Corominas, V. Martínez-Taboada, A. Erra, S. Sánchez-Fernández, A. Alonso, M. López-Lasanta, R. Tortosa, L. Codó, J L. Gelpí, A. C. García-Montero, J. Bertranpetit, D. Absher, L. S Bridges, R. M. Myers, J. Tornero, and S. Marsal
• Parmbsc1: a refined force field for DNA simulations

  Nature Methods

  I. Ivani, P. D. Dans, A. Noy, A. Pérez, I. Faustino, A. Hospital, J. Walther, P. Andrio, R. Goñi, A. Balaceanu, G. Portella, F. Battistini, J L. Gelpí, C. González, M. Vendruscolo, C. A. Laughton, S. A. Harris, D. A. Case, and M. Orozco
• Genome-Wide Pathway Analysis Identifies Genetic Pathways Associated with Psoriasis

  Journal of Investigative Dermatology

  A. Aterido, A. Julià, C. Ferrándiz, L. Puig, E. Fonseca, E. Fernández-López, E. Dauden, J L. Sánchez-Carazo, J L. López-Estebaranz, D. Moreno-Ramírez, F. Vanaclocha, E. Herrera, P. de la Cueva, N. Dand, N. Palau, A. Alonso, M. López-Lasanta, R. Tortosa, A. García-Montero, L. Codó, J L. Gelpí, J. Bertranpetit, D. Absher, F. Capon, R. M. Myers, J. N. Barker, and S. Marsal